扩增子(amplicon)为DNA或RNA扩增后的一段核苷酸序列。比如通过PCR扩增得到的某个基因的扩增片段。更简单地说,扩增子是经过人工扩增的DNA片段或RNA片段的扩增产物。
2023年11月15日 · 本篇文章为您带来浅显易懂的扩增子测序技术解析,包括核糖体基本结构与功能、扩增子测序原理、方法,以及在实际应用案例分析。 此外,还将深入探讨数据处理、分析方法以及未来发展方向和挑战。
2024年11月1日 · 扩增子测序是一种专门用于表征生物体内特定基因组区域或保守区域,并研究其遗传变异的测序方法。 与需要覆盖整个基因组的全基因组测序不同,扩增子测序采用聚合酶链式反应(PCR)技术,有选择性地扩增感兴趣的基因区域并进行测序。
摘要:扩增子测序是目前微生物组研究中最广泛的使用手段,主流的分析流程有QIIME、 USEARCH 和Mothur,但仍分别存在依赖关系过多导致的安装困难、大数据收费和使 用界面不友好等问题。本文搭建了一套完整的扩增子分析流程命名为易扩增子
2020年3月20日 · 扩增子测序是指利用合适的通用引物扩增环境中微生物的16s rdna/18s rdna /its高变区或功能基因,通过高通量测序技术检测pcr产物的序列变异和丰度信息,分析该环境下的微生物群落的多样性和分布规律,以揭示环境样品中微生物的种类、相对丰度、进化关系等。
16s扩增子测序是指利用合适的通用引物扩增环境中微生物的16s rdna/18s rdna /its高变区或功能基因,通过高通量测序技术检测pcr产物 的序列变异和丰度信息,分析该环境下的微生物群落的多样性和分布规律, 以揭示环境样品中微生物的种类、相对丰度、进化关系等。
2020年5月19日 · 扩增子(amplicon)为DNA或RNA扩增后的一段核苷酸序列。比如通过PCR扩增得到的某个基因的扩增片段。 更简单地说,扩增子是经过人工扩增的DNA片段或RNA片段的扩增产物。
什么是扩增子? 扩增子测序是指利用合适的通用引物扩增环境中微生物的16S rDNA/18S rDNA /ITS高变区或功能基因,通过高通量测序技术检测PCR产物的序列变异和丰度信息,分析该环境下的微生物群落的多样性和分布规律,以揭示环境样品中众多的微生物种类及它们 ...
扩增子测序是微生物组分析中使用最广泛的测序方法,几乎可以应用于所有类型的样品。 扩增子测序中使用的主要标记基因包括用于原核生物的16S rDNA、用于真核生物的18S rDNA和内转录间隔区(internal transcribed spacers, ITS)。
pcr 基因扩增 原理. pcr的基本原理是利用 dna双链 在高温下解链(变性)后,特异性引物在低温下与模板dna单链结合(退火),然后在适宜的温度下dna聚合酶以引物为起点合成新链(延伸),从而实现dna片段的扩增。这个过程在热循环仪中进行,可多次循环,获得 ...